El proyecto RIS3CAT VEIS creará un ecosistema abierto de tecnologías que cubra y se adapte a las necesidades de análisis e interpretación de datos ómicos y clínicos en entornos de investigación y aplicación en biomedicina, a través de la base de datos EGA.
Socios
Proyectos
Herramientas
Plataformas
Publicaciones
Materials de formació
El proyecto VEIS desarrolla y ejecuta las tareas previstas en 7 subproyectos. Los socios de VEIS organizan sus actividades de forma transversal en 5 grupos de trabajo colaborativos.
Diseminar el ecosistema de herramientas del Barcelona Computational Biomedical Ecosystem (BCBE), así como formar usuarios, desarrolladores y formadores en el mismo, mediante una serie de cursos incluidos los de puesta al día de profesionales del sector, y otras actividades formativas y de difusión.
Crear una estrategia para asegurar la sostenibilidad de los desarrollos generados durante el proyecto aún después de ser finalizado.
Facilitar el diálogo entre EGA y el ecosistema de herramientas de BCBE mediante una extensión de las actuales API y de los protocolos de autenticación y autorización.
Elaborar un catálogo de los sistemas desarrollados y mantenidos por los socios de VEIS, que constituyen el ecosistema BCBE. El catálogo debe proporcionar información sobre la funcionalidad de dichos sistemas, el tipo y formato de los datos que necesitan como entrada y los que proporciona como salida. Este proyecto permitirá que el ecosistema BCBE se pueda alinear con infraestructuras internacionales con objetivos similares.
Armonizar los vocabularios controlados utilizados por las herramientas y EGA y mejorar el descubrimiento de datos.
Implementar un marco de evaluación comparativa en términos técnicos, funcionales y científicos de los sistemas desarrollados y mantenidos por los socios de VEIS. Este marco permitirá elegir el mejor sistema a utilizar del BCBE siguiendo una combinación de criterios objetivos donde, no solo se considere la validez del resultado científico, sino también los requerimientos técnicos y la eficiencia técnica y funcional.
Evaluar componentes del ecosistema BCBE en entornos clínicos, usando como punto de partida los proyectos en los que socios de VEIS están implicados. Los entornos de investigación clínica proporcionan el marco ideal para evaluar sus funcionalidades en cuanto al acceso a la información en EGA, el grado de interoperabilidad entre los distintos componentes y sistemas, así como el grado de necesidad de la conexión entre distintas herramientas y sistemas. Finalmente, también será el marco ideal para identificar posibles nuevos desarrollos metodológicos que sean necesarios en distintos escenarios de investigación clínica.